Python实现K-Means聚类算法:原理、代码与可视化详解
本文详细解析Python中K-Means聚类算法的实现过程,涵盖算法优缺点、核心思想及关键步骤。通过提供完整的Python代码示例,展示如何加载数据、计算欧氏距离、生成初始质心并迭代优化。同时结合可视化结果,直观展示聚类效果及局部最优问题,帮助开发者深入理解并应用该算法。
算法优缺点:
优点:实现简单直观。 缺点:容易陷入局部最小值,且在处理大规模数据集时收敛速度较慢。 适用数据类型:仅适用于数值型数据。
算法思想
K-Means算法的核心在于计算样本点之间的距离,依据距离的远近将样本划分到不同的类别中,距离越近的样本归为同一类。
1. 首先确定K值,即期望将数据划分为多少个簇。K值的选择对最终结果影响显著。Ng课程中提到的两种选择方法包括:肘部法则(Elbow Method),即通过观察聚类结果与K值之间的函数关系,寻找效果最佳的K值;另一种是根据具体业务需求确定,例如在衬衫尺寸聚类中,可能直接设定为L、M、S三类。
2. 选择初始聚类点(质心)。通常采用随机策略,代码中实现在数据范围内随机生成点,或者从数据集中随机选取点。质心的选择对最终结果影响巨大,若运气不佳可能导致算法收敛到局部最小值。对此有两种处理策略:一是多次运行取平均值,二是采用改进算法如二分K-Means(Bisecting K-Means)。
3. 进入核心迭代过程。计算数据集中所有点到当前各质心的距离,将每个点分配到距离最近的质心所属的簇。随后,重新计算每个簇中所有点的平均值,将其作为新的质心。重复上述“分配-更新”步骤,直到算法收敛,从而得到最终聚类结果。
函数
loadDataSet(fileName)
从文件中读取数据集
distEclud(vecA, vecB)
计算距离,此处采用欧氏距离,当然其他合理的距离度量方式亦可使用。
randCent(dataSet, k)
随机生成初始质心,此处通过选取数据范围内的随机点来实现。
kMeans(dataSet, k, distMeas=distEclud, createCent=randCent)
K-Means算法主函数,接收数据集和K值作为输入。后两个参数为可选,分别指定距离计算方式和初始质心生成方式。
show(dataSet, k, centroids, clusterAssment)
可视化结果
#coding=utf-8
from numpy import *
def loadDataSet(fileName):
dataMat = []
fr = open(fileName)
for line in fr.readlines():
curLine = line.strip().split('\t')
fltLine = map(float, curLine)
dataMat.append(fltLine)
return dataMat
#计算两个向量的距离,用的是欧几里得距离
def distEclud(vecA, vecB):
return sqrt(sum(power(vecA - vecB, 2)))
#随机生成初始的质心(ng的课说的初始方式是随机选K个点)
def randCent(dataSet, k):
n = shape(dataSet)[1]
centroids = mat(zeros((k,n)))
for j in range(n):
minJ = min(dataSet[:,j])
rangeJ = float(max(array(dataSet)[:,j]) - minJ)
centroids[:,j] = minJ + rangeJ * random.rand(k,1)
return centroids
def kMeans(dataSet, k, distMeas=distEclud, createCent=randCent):
m = shape(dataSet)[0]
clusterAssment = mat(zeros((m,2)))#create mat to assign data points
#to a centroid, also holds SE of each point
centroids = createCent(dataSet, k)
clusterChanged = True
while clusterChanged:
clusterChanged = False
for i in range(m):#for each data point assign it to the closest centroid
minDist = inf
minIndex = -1
for j in range(k):
distJI = distMeas(centroids[j,:],dataSet[i,:])
if distJI < minDist:
minDist = distJI; minIndex = j
if clusterAssment[i,0] != minIndex:
clusterChanged = True
clusterAssment[i,:] = minIndex,minDist**2
print centroids
for cent in range(k):#recalculate centroids
ptsInClust = dataSet[nonzero(clusterAssment[:,0].A==cent)[0]]#get all the point in this cluster
centroids[cent,:] = mean(ptsInClust, axis=0) #assign centroid to mean
return centroids, clusterAssment
def show(dataSet, k, centroids, clusterAssment):
from matplotlib import pyplot as plt
numSamples, dim = dataSet.shape
mark = ['or', 'ob', 'og', 'ok', '^r', '+r', 'sr', 'dr', '<r', 'pr']
for i in xrange(numSamples):
markIndex = int(clusterAssment[i, 0])
plt.plot(dataSet[i, 0], dataSet[i, 1], mark[markIndex])
mark = ['Dr', 'Db', 'Dg', 'Dk', '^b', '+b', 'sb', 'db', '<b', 'pb']
for i in range(k):
plt.plot(centroids[i, 0], centroids[i, 1], mark[i], markersize = 12)
plt.show()
def main():
dataMat = mat(loadDataSet('testSet.txt'))
myCentroids, clustAssing= kMeans(dataMat,4)
print myCentroids
show(dataMat, 4, myCentroids, clustAssing)
if __name__ == '__main__':
main()
此处展示聚类结果,效果良好。

然而,算法有时可能收敛至局部最小值,如下例所示,即不幸陷入了局部最优解。

总结
以上为Python实现K-Means聚类算法的完整详解,希望能对大家有所帮助。感兴趣的朋友可继续查阅本站其他文章:
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